Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms