Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tuba4aP68368 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tuba4aP68368 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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