Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Snrpd1P62315 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snrpd1P62315 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snrpd1P62315 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snrpd1P62315 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snrpd1P62315 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snrpd1P62315 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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