Protein–RNA interactions for Protein: P56567

Csta, Cystatin-A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CstaP56567 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CstaP56567 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CstaP56567 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CstaP56567 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CstaP56567 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CstaP56567 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CstaP56567 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CstaP56567 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CstaP56567 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CstaP56567 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CstaP56567 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CstaP56567 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms