Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtswP56203 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtswP56203 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtswP56203 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtswP56203 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtswP56203 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtswP56203 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CtswP56203 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CtswP56203 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CtswP56203 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms