Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrlP54846 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrlP54846 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrlP54846 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrlP54846 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrlP54846 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrlP54846 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrlP54846 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NrlP54846 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrlP54846 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrlP54846 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrlP54846 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NrlP54846 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NrlP54846 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms