Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms