Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcd1P48410 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms