Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cap1P40124 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms