Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf2P39429 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Traf2P39429 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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