Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TtlP38585 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtlP38585 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms