Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tfap2aP34056 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tfap2aP34056 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tfap2aP34056 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tfap2aP34056 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tfap2aP34056 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tfap2aP34056 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms