Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifnar1P33896 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnar1P33896 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms