Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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