Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RxraP28700 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RxraP28700 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RxraP28700 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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