Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Pde6aP27664 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pde6aP27664 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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