Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChgaP26339 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ChgaP26339 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms