Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NdnP25233 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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NdnP25233 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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NdnP25233 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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NdnP25233 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NdnP25233 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NdnP25233 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NdnP25233 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NdnP25233 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NdnP25233 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NdnP25233 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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