Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

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Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HdcP23738 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HdcP23738 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HdcP23738 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HdcP23738 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HdcP23738 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HdcP23738 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HdcP23738 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HdcP23738 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HdcP23738 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HdcP23738 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HdcP23738 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HdcP23738 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HdcP23738 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HdcP23738 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HdcP23738 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HdcP23738 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HdcP23738 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HdcP23738 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HdcP23738 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HdcP23738 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HdcP23738 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms