Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ggta1P23336 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms