Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klra1P20937 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klra1P20937 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klra1P20937 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klra1P20937 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klra1P20937 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klra1P20937 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klra1P20937 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klra1P20937 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klra1P20937 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klra1P20937 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klra1P20937 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klra1P20937 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klra1P20937 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms