Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csn1s1P19228 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csn1s1P19228 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms