Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RargP18911 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RargP18911 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RargP18911 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms