Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18530 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18530 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18530 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms