Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18528 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18528 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P18528 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P18528 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18528 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms