Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrphP15331 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrphP15331 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrphP15331 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrphP15331 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms