Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Calb1P12658 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Calb1P12658 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms