Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Tnp2P11378 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Tnp2P11378 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Tnp2P11378 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Tnp2P11378 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Tnp2P11378 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Tnp2P11378 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Tnp2P11378 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Tnp2P11378 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Tnp2P11378 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Tnp2P11378 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp2P11378 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp2P11378 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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