Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd4P10628 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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