Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Becn2P0DM65 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Becn2P0DM65 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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