Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cited2O35740 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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