Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccrl2O35457 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms