Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Abcc1O35379 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
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Abcc1O35379 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Abcc1O35379 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Abcc1O35379 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Abcc1O35379 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Abcc1O35379 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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