Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EllO08856 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
EllO08856 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EllO08856 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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