Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930544D05RikJ3QK56 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms