Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmn1r58G3X9U3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r58G3X9U3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms