Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SprtnG3X912 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms