Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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