Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms