Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
ApobE9Q414 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
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