Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3002E9PW72 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms