Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grik3B1AS29 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms