Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms