Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf2A3KGV1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms