Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ism1A2ATD1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ism1A2ATD1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms