Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp8nlA2ABX0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp8nlA2ABX0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms