Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam171a2A2A699 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam171a2A2A699 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms