Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms