Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5538W4VSP6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms