Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn8Q9Z260 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn8Q9Z260 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms